Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Defa1P11477 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms