Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Itgb1P09055 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms