Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp4O70480 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp4O70480 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms