Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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BckdkO55028 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
BckdkO55028 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms