Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Kcns1O35173 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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