Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Gm5294J3QP53 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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