Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Atf6F6VAN0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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