Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm17333C6EQI3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17333C6EQI3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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