Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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PtprsB0V2N1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
PtprsB0V2N1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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