Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Tmem238A9JSM3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms