Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Skint4A7TZF3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms