Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
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Atp8b5A3FIN4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Atp8b5A3FIN4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atp8b5A3FIN4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms