Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Top3bQ9Z321 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Top3bQ9Z321 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Top3bQ9Z321 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Top3bQ9Z321 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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