Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Vamp5Q9Z2P8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Vamp5Q9Z2P8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Vamp5Q9Z2P8 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms