Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slit2Q9R1B9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slit2Q9R1B9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms