Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf4Q9QZS2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf4Q9QZS2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms