Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim44Q9QXA7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim44Q9QXA7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Trim44Q9QXA7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim44Q9QXA7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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