Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Trappc2lQ9JME7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc2lQ9JME7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc2lQ9JME7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc2lQ9JME7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc2lQ9JME7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc2lQ9JME7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc2lQ9JME7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Trappc2lQ9JME7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Trappc2lQ9JME7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
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