Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ldb3Q9JKS4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms