Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Vmn1r46Q9EQ45 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Vmn1r46Q9EQ45 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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