Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Pdzd9Q9D9M4 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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