Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn22Q9D7U6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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