Protein–RNA interactions for Protein: Q9D304

Rnf128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf128Q9D304 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf128Q9D304 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf128Q9D304 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms