Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Mrpl28Q9D1B9 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms