Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ChtopQ9CY57 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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