Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pard3bQ9CSB4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Pard3bQ9CSB4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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