Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Commd4Q9CQ02 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms