Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Nsmce3Q9CPR8 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Nsmce3Q9CPR8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms