Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp1b4Q99ME6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms