Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ciao1Q99KN2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms