Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atl3Q91YH5 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atl3Q91YH5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms