Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Fam20bQ8VCS3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Fam20bQ8VCS3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Fam20bQ8VCS3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam20bQ8VCS3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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