Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms