Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ssx2ipQ8VC66 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx2ipQ8VC66 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx2ipQ8VC66 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx2ipQ8VC66 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx2ipQ8VC66 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx2ipQ8VC66 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ssx2ipQ8VC66 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms