Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ssh3Q8K330 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ssh3Q8K330 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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