Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Nek9Q8K1R7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Nek9Q8K1R7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Nek9Q8K1R7 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Nek9Q8K1R7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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