Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pkn3Q8K045 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms