Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp44Q8C2S0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp44Q8C2S0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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