Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc21aQ8C0S4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ttc21aQ8C0S4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21aQ8C0S4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21aQ8C0S4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ttc21aQ8C0S4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Ttc21aQ8C0S4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21aQ8C0S4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21aQ8C0S4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21aQ8C0S4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ttc21aQ8C0S4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc21aQ8C0S4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc21aQ8C0S4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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