Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Kdm4aQ8BW72 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms