Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Ttc28Q80XJ3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ttc28Q80XJ3 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ttc28Q80XJ3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms