Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

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Length 2,453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ptpn13Q64512 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ptpn13Q64512 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Ptpn13Q64512 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Ptpn13Q64512 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ptpn13Q64512 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms