Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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