Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sema3cQ62181 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sema3cQ62181 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sema3cQ62181 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3cQ62181 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3cQ62181 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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