Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Itga6Q61739 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms