Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PcolceQ61398 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms