Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Fam208bQ5DTT3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Fam208bQ5DTT3 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms