Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Rmi2Q3UPE3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Rmi2Q3UPE3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms