Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Skap2Q3UND0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Skap2Q3UND0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms