Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp4Q3U4B1 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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